Hay nuevos genes que se fusionan con cáncer / WITH ENGLISH VERSION
Científicos de la universidad de Michigan hacen descubrimiento. Nueva tecnologías para detectar la fusión de genes abre una nueva área de investigación en cáncer.
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ANN ARBOR, Michigan.— Un equipo de investigadores en el Centro Integral del Cáncer de la Universidad de Michigan, utilizó nuevas tecnologías que facilitan el conocimiento de la secuencia del genoma humano, ha identificado una serie de genes que se funden cuando canjean sus cromosomas. Se piensa que esta fusión repetida de genes es el mecanismo que hace que se desarrollen ciertos cánceres.
Las fusiones de genes descubiertas podrían servir, algún día, para el diagnóstico del cáncer o como blanco para el desarrollo de futuros medicamentos.
En un nuevo estudio que publica la revista Nature los investigadores identificaron varias fusiones de genes en las células del cáncer de próstata. Algunas de las fusiones se observaron en múltiples líneas de células estudiadas, en tanto que otras fusiones de genes aparecieron sólo una vez. Las fusiones se encontraron en las células de cáncer y no en las células normales.
"Hemos definido una nueva clase de mutaciones en el cáncer de próstata. Se piensa que las fusiones recurrentes son el mecanismo que promueve el cáncer. Pero encontramos asimismo otras fusiones, algunas de las cuales fueron únicas en pacientes individuales. Nuestro próximo paso es entender si éstas desempeñan un papel promotor de la enfermedad", dijo Azul Chinnaiyan, director del Centro Michigan para Patología Transnacional y académico de la Cátedra S.P. Hicks de Patología en la Escuela de Medicina de la UM.
El equipo de Chinnaiyan fue el primero que ha identificado los ajustes de cromosomas y los genes fusionados en el cáncer de próstata. Ya se sabía antes que las fusiones de genes desempeñan un papel en los cánceres de células de la sangre tales como la leucemia y el linfoma, y en el sarcoma de Ewing.
En el estudio actual los investigadores muestran que las técnicas más novedosas podrían identificar con más rapidez y facilidad estas fusiones de genes.
Los investigadores usaron una técnica llamada secuencia de gene, que involucra la creación de un archivo de todo el ácido ribonucleico en una célula. Las máquinas de secuencia luego operan 24 horas por día durante días leyendo el ARN. Una vez que se completa la secuencia, los investigadores estudian los datos en búsqueda de fusiones de genes.
Éste es un método aún más directo que el usado por el laboratorio de Chinnaiyan cuando identificó por primera vez las fusiones de genes en el cáncer de próstata, un proceso llamado microensayo. El uso de la tecnología de microensayo los investigadores debían saber primero qué es lo que buscaban. Con la secuencia de gen los investigadores pueden encontrar lo que haya allí sin saber antes dónde buscarlo.
"Ahora tenemos la capacidad de usar la tecnología de secuencia de la siguiente generación. Esto amplía el campo en la investigación del cáncer", dijo Chinnaiyan, un investigador en el Instituto Médico Howard Hughes. Si bien el estudio actual se concentró en el cáncer de próstata, su equipo también busca fusiones de genes en el cáncer de mamas, el de pulmón y el melanoma.
Las conclusiones: Los investigadores probaron una tecnología de secuencia de genes para ver si podrían encontrar las mismas fusiones de genes que se habían encontrado usando otras tecnologías. Además de verificar las fusiones de genes conocidas los investigadores hallaron nuevas fusiones de genes que son comunes entre algunas muestras de tumores. Se identificaron fusiones de genes adicionales en muestras de tumores individuales. (Universidad de Michigan News)
U-M researchers discover new genes that fuse in cancer. New technology for detecting gene fusions opens field in cancer research.
ANN ARBOR, Mich. — Using new technologies that make it easier to sequence the human genome, researchers at the University of Michigan Comprehensive Cancer Center have identified a series of genes that become fused when their chromosomes trade places with each other. These recurrent gene fusions are thought to be the driving mechanism that causes certain cancers to develop.
The gene fusions discovered could potentially serve as a marker one day for diagnosing cancer or as a target for future drug development.
In the new study, published in Nature, the researchers identified several gene fusions in prostate cancer cells. Some of the fusions were seen in multiple cell lines studied, while other gene fusions appeared only once. The fusions were found only in cancer cells, and not in normal cells.
“We defined a new class of mutations in prostate cancer. The recurrent fusions are thought to be the driving mechanism of cancer. But we found other fusions as well, some of which were unique to individual patients. Our next step is to understand if these play a role in driving disease,” says Arul Chinnaiyan, M.D., Ph.D., director of the Michigan Center for Translational Pathology and S.P. Hicks Endowed Professor of Pathology at the U-M Medical School.
Chinnaiyan’s team was the first to identify rearrangements in chromosomes and fused genes in prostate cancer. Gene fusions had previously been known to play a role in blood cell cancers such as leukemia and lymphoma, and in Ewing´s sarcoma.
In the current study, the researchers showed that newer techniques could identify these gene fusions more quickly and easily.
The researchers used a technique called gene sequencing, which involves creating a library of all RNAs in a cell. Sequencing machines then run 24 hours a day for days at a time, reading the RNA. Once the sequencing is finished, researchers study the data searching for the gene fusions.
This is a more direct approach than the method Chinnaiyan’s lab used to first identify gene fusions in prostate cancer, a process called microarray. Using microarray technology, researchers had to first know where they wanted to look. With gene sequencing, the researchers can find what’s there without knowing where to look first.
“We now have the ability to use next generation sequencing technology. This will open up the field in cancer research,” says Chinnaiyan, a Howard Hughes Medical Institute investigator. While the current study focused on prostate cancer, his team is also looking at gene fusions involved in breast cancer, lung cancer and melanoma. (Michigan’s University News)
Photo Caption:
(L-R) Authors: Chandan Kumar, Arul Chinnaiyan, Christopher Maher. Photo: Michigan’s University News
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